درحال بارگذاري...
جستجو
| ایمیل دوست | |
| نام شما | |
| ایمیل شما | |
| کد مقابل را وارد نمایید | |
این صفحه برای دوست شما با موفقیت ارسال شد.
فهرست محتوای دیجیتالی
فهرست مطالب
فهرست نقدها
321 مرتبه مشاهده شده
ادغام دادههای مالتیومیک تک - سلول با استفاده از شبکههای عصبی عمیق
امیدی، علیرضا Omidi, Alireza
- شماره پایان نامه:54502
- کد دانشکده:19
- پديدآور: امیدی، علیرضا
- عنوان:ادغام دادههای مالتیومیک تک - سلول با استفاده از شبکههای عصبی عمیق.
- نام دانشگاه/پژوهشگاه:صنعتی شریف
- سال اخذ مدرك:1400.
- نام دانشکده:مهندسی کامپیوتر
- مقطع:کارشناسی ارشد
- گرایش:هوش مصنوعی
- توصیف ظاهری:76ص.: جدول، نمودار، کتابنامه؛ چکیده به فارسی و انگلیسی
- توصیفگر: شبکه های عصبی عمیق Deep Neural Networks
- توصیفگر: خودرمزگذار تغییراتی Variational Autoencoder
- توصیفگر: توالی یابی تک سلول Single Cell Sequencing
- توصیفگر: ادغام داده Data Aggregation
- توصیفگر: دادههای مالتیومیک Multi-Omic Data
- توصیفگر: نگاشت دادگان جدید Query to Reference Mapping
- استاد راهنما. شریفی زارچی، علی
-
محتواي کتاب
- مشاهده
- مقدمه و پیشنیازها
- پیشنیازهای زیستشناسی
- خودرمزگذار
- تعریف مسئله ادغام دادگانهای تک-سلول
- تعریف مسئله نگاشت دادگان تک-سلول جدید به ادغام مرجع
- ویژگیهای داده و مسئله
- اهداف تحقیق
- ساختار پایاننامه
- پژوهشهای پیشین
- روش MOFA+
- روش Seurat
- روش totalVI
- روش MMD-MA
- روش UnionCom
- روش Cross-modal Autoencoder
- روش SCIM
- روش scArches
- جمعبندی
- روش پیشنهادی
- معماری
- بهینهسازی
- خطای بازسازی
- خطای واگرایی KL
- خطای ادغام
- خطای ثبات دور
- روش پیشنهادی برای نگاشت به ادغام مرجع
- چارچوب ارزیابی
- دادگانهای مورد بررسی
- دادگان توالییابی همزمان آرانای و اتک 10x Genomics
- دادگان توالییابی همزمان آرانای و پروتئینهای سطحی
- دادگان توالییابی همزمان آرانای و پروتئینهای سطحی بیماران مبتلا به کووید۱۹
- معیارهای اندازهگیری کارایی مدل در ادغام دادههای تک-سلول
- معیار Average silhouette width (ASW)
- معیار Graph connectivity
- معیار Normalised mutual information (NMI)
- معیار Adjusted Rand Index (ARI)
- معیار Isolated label silhouette
- نحوه ارزیابی کیفیت نگاشت دادگان جدید به ادغام مرجع
- مطالعه تاثیر ابرپارامترهای مدل بر روی کارایی آن
- جمعبندی
- دادگانهای مورد بررسی
- ارزیابی
- ارزیابی کارایی مدل بر روی دادگانهای جفتشده
- ارزیابی کارایی مدل بر روی دادگانهای جفت نشده
- ارزیابی کارایی مدل در نگاشت دادگان جدید به ادغام مرجع
- مطالعه تاثیر ابرپارامترهای مدل بر روی کارایی آن
- نتیجهگیری و کارهای آتی
- تصاویر و جداول تکمیلی